علت این بیماری زیاد بودن کروموزومهای جنسی در مرد می باشد. در شرایط طبیعی فرمول جنسی کروموزومهای مرد xy می‌باشد ولی در این بیماری فرد دارای یک کروموزوم x اضافی می‌باشد و در موارد نادری دارای ۲ الی ۳x اضافه می‌باشد.
با این که الزاماً این افراد مشکلات ذهنی و اختلالات یادگیری ندارند، اما افزایش تعداد کروموزومهای x اضافی، کارایی مغز این افراد را کاهش می‌دهد. طبیعی است که این سندرم تنها در افراد مذکر روی می‌دهد.این بیماری یک در هر ۱۰۰۰ تولد نوزاد پسر رخ می‌دهد و زمانی که سن خانمی موقع بارداری 35 سال به بالا باشد،احتمال بروز این سندروم بیشتر می شود.